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《土壤》创刊于1958年10月，当时为月刊，由中国科学院土壤队主办。1960年2月中国科学院土壤队改建为中国科学院土壤及水土保持研究所，《土壤》随之改由该所主办，并于次年8月改为双月刊。1961年11月，中国科学院土壤及水土保持研究所与中国科学院南京土壤研究所合并，《土壤》归中国科学院南京土壤研究所主办。1962年8月《土壤》又与中国土壤学会主办的《土壤通报》合并而停刊。
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